총독 아퐁수 드 알부케르크는 1510년 인도의 고아, 1511년 말레이반도의 말라카, 1515년 페르시아만의 호르무즈를 차지했다. 포르투갈은 이 항구들에 요새를 두고, 자기들이 발급한 통행증을 사지 않은 배는 공격했다. 이렇게 이어진 거점 체계를 ‘인도령(이스타두 다 인디아)’이라 불렀다.
포르투갈 상인은 더 동쪽으로 나아가 1557년 중국 마카오에 머무를 권리를 얻었다. 1543년에는 포르투갈인을 태운 배가 일본 남쪽 다네가시마에 닿아 화승총(조총)을 전했다. 일본은 이 총을 빠르게 복제해 대량으로 만들었고, 1592년 임진왜란 때 일본군의 조총은 조선군에 큰 위협이 되었다.
1549년에는 예수회 선교사 하비에르가 일본에 와 기독교를 전했고, 1571년부터 나가사키는 포르투갈 무역의 중심이 되었다. 포르투갈은 중국 비단과 일본 은을 서로 바꿔 주는 중계 무역으로 큰 이익을 얻었다. 작은 나라 포르투갈이 세계 바다를 이은 이 그물은, 17세기에 네덜란드가 나타나면서 흔들리게 된다.