1794년 7월 27일(혁명력 테르미도르 9일) 국민 공회는 로베스피에르를 체포했고 그는 이튿날 처형되었다. 이를 테르미도르 반동이라 한다. 공포 정치는 끝났지만 이번에는 자코뱅파가 보복을 당했다.
1795년 새 헌법으로 5명의 총재가 이끄는 총재 정부가 들어섰다. 그러나 물가는 치솟고 부정부패가 심했으며, 왕당파와 급진파의 반란이 번갈아 일어났다. 정부는 갈수록 군대에 기대게 되었다. 그사이 코르시카 출신 젊은 장군 나폴레옹 보나파르트는 이탈리아 원정(1796~1797)과 이집트 원정(1798~1799)으로 이름을 떨쳤다.
이집트에서 몰래 돌아온 나폴레옹은 1799년 11월 9~10일(브뤼메르 18~19일) 시에예스 등과 손잡고 군대를 동원해 의회를 해산했다(브뤼메르 쿠데타). 그는 3명의 통령 가운데 제1통령이 되어 모든 실권을 쥐었다. 흔히 이 사건을 프랑스 혁명의 사실상의 끝으로 본다.