1864년 북부의 셔먼 장군은 애틀랜타를 점령한 뒤 바다까지 행군하며 철도와 농장, 창고를 파괴했다. 남부의 전쟁 능력을 꺾으려는 전략이었지만 민간의 피해도 컸다. 그랜트는 버지니아에서 리의 군대를 끈질기게 압박했다.
1865년 4월 남부의 수도 리치먼드가 함락되었고, 4월 9일 리 장군은 버지니아 애퍼매톡스 코트하우스에서 그랜트에게 항복했다. 그러나 4월 14일 링컨은 워싱턴의 극장에서 남부 지지자에게 총을 맞고 이튿날 숨졌다.
남북 전쟁의 사망자는 약 62만~75만 명으로 추정되며, 미국 역사상 가장 많은 미국인이 숨진 전쟁이다. 1865년 12월 수정 헌법 제13조가 확정되어 미국 전역에서 노예제가 폐지되었다.